Cordobeses desarrollan software que mide respuesta inmune contra todo tipo de cáncer

Investigadores desarrollaron una herramienta bioinformática que puede cuantificar «de manera muy precisa» la cantidad y el tipo de glóbulos blancos que se infiltran en tumores, lo que ayudaría a explicar por qué en algunos casos fallan las inmunoterapias contra el cáncer, informaron sus desarrolladores, pertenecientes a la Universidad Católica de Córdoba (UCC) y al Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (Conicet).

Mixture, el nombre que lleva la herramienta, es un software que permite comparar la secuenciación genética de la muestra de un tumor con la secuenciación genética de las células del sistema inmune y estimar, a partir de encontrar las coincidencias, qué porcentaje de cada una de estas células está presente en el tumor.

«Lo que nosotros hicimos fue mejorar algoritmos que ya existían, que son alimentados por ‘niveles de expresión’ de los genes de una muestra tumoral; a la vez, los niveles de expresión se obtienen mediante otra tecnología, que es la secuenciación genética (que es la traducción en letras y números del material genético)», detalló a Elmer Fernández, investigador del Centro de Investigación y Desarrollo en Inmunología y Enfermedades Infecciosas (Cidie), que depende de la UCC y del Conicet.

Y continuó: «Esa secuencia de cada gen de la muestra la ingresamos y el software la analiza y compara con los perfiles de expresión de los tipos celulares del sistema inmune y estima la cantidad de los 22 tipos celulares codificados en una matriz de expresión de genes de esos tipos celulares: por ejemplo, del tipo 1 se tienen 15%, del tipo 2 nada».

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